大事紀
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1986年2月
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陽明山國家公園區域為「建築法」建築法適用地區。
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1986年2月
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墾丁國家公園南仁山研究站完工啟用，提供學術研究的基地(2月7日)。（報導）
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1986年3月
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陽明山國家公園警察隊正式成立(3月13日)。
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1986年3月
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玉山國家公園警察隊正式成立，由原任墾丁國家公園警察隊副隊長劉丕傑擔任隊長(3月18日)。
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1986年5月
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臺大植物系教授郭城孟花10多年的時間，終時間，於在墾丁國家公園內找到世界級的稀有植物～分枝莎草蕨(5月21日)。不料發現後3個月，某單位竟在這個山頭上大興土木，破壞分枝莎草蕨的生長環境(5月21日)。
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1986年5月
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墾丁國家公園管理處墾管處委託臺大動物系教授林曜松與淡水魚專家曾晴賢，完成南仁山生態保護區淡水魚類及水生無脊椎動物研究，發現21種魚類，其中3種是台灣新記錄種(5月29日)。
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1986年8月
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陽管處於向天池發現淡水豐年蝦，為臺灣境內首度發現。
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1986年9月
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圓山動物園搬遷梅花鹿到木柵新園時，留下30隻送給墾丁國家公園實施野外「復育計劃計畫」，希望使臺灣再度重視野生梅花鹿(9月27日)。
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1986年10月
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「玉山通訊」玉山通訊第一期出刊，由玉山義務解說員主導的刊物(10月1日)。
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1986年10月
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行政院院會正式通過「太魯閣國家公園計劃計畫」(10月10日)。
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1986年11月
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陽管處成立「陽明山國家公園簡訊」編輯委員會(11月7日)。
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1986年11月
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太管處正式成立，處址暫設綠水，徐國士出任處長(11月28日)。（報導）
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1986年12月
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陽管處簡訊創刊。（報導）
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1986年12月
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墾丁國家公園管理處墾管處委託中華民國自然生態保育協會中華民國自然生態保育協會為欖仁溪攔沙壩設計規劃魚道時，研究人員曾晴賢意外發現6種臺灣新魚種。同時又在淡水水域中找到10種原本在文獻中記載為海水性的魚類(12月15日)。
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1987年3月
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墾丁國家公園管理處墾管處鳥類專家劉川近2年半的觀察研究指出，龍鑾潭鳥類資源豐富，共發現16種特殊稀有鳥類(3月4日)。
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1987年5月
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墾丁國家公園貓鼻頭遊憩區設施完工。(報導)
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1987年6月
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陽明山國家公園帝雉、藍腹鷳鷴人工繁殖計畫獲重大突破，計孵出帝雉2隻，藍腹鷳鷴5隻，為國內政府機關人工繁殖此2種珍稀鳥類成功先例。
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1987年7月
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陽管處正式推動實施「陽明山國家公園環境整建方案」。
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1987年10月
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墾丁國家公園進行臺灣蝴蝶蘭野外復植工作。(報導)
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1987年10月
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「陽明山國家公園進入生態保護區申請須知」訂定實施。
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