0403震災後砂卡礑步道損毀嚴重雖處於封閉狀態，但太管處仍堅持長期以來的溪流生態監測工作，在安全第一的前提下，持續讓巡守員進行砂卡礑溪與立霧溪匯流口周邊之水生生態調查。令人欣喜的是依據監測結果，當地溪流生態並未見明顯衰退，充分展現大自然的自癒能力。未來隨著災修進度的推進，太管處也將逐步恢復其他區段的溪流監測工作，讓保育工作不中斷。
根據調查，砂卡礑溪常見的原生溪流生物種類豐富，如：臺灣扁絨螯蟹、貪食沼蝦、短腕沼蝦、日本瓢鰭鰕虎及大吻鰕虎等。由於近年來砂卡礑溪監測到臺灣石?的出現並大量繁殖，威脅當地原生種苦花等物種族群，另外粗糙沼蝦也有逐步擴散的趨勢，這些非當地原生物種的出現，對溪流生態產生了極大影響，對此太管處亦積極進行入侵物種移除工作，以維護砂卡礑溪的生物多樣性。
一次一次的地質變化，造就了令人驚嘆的太魯閣地貌，給大地一些休養生息的時間，相信生態終會達到自身的平衡！
